みんなが「気つかない」ということは、すでにこの看板は「記号」として機能してるとみてよろしいのでしょうか？

　　つまり、何も考えずに見ても「段差がある」ということが自明となってると・・・。

パッと見て不自然とも思わず、誰もが即座に意味を解し、さほど気に留めることもない。
ちょっと考えれば、本当はこんなに変なのに……。

というのが記事の趣旨でしょう。
だったら、それをわざわざもう１度ひっくりかえして「すでに記号として機能している！」……なんて発見は無意味でしょ。
そこで気付いちゃった人間の感じる違和感を大事にしながらコメントを付けるべきなんじゃないかな。
ねえ、知求人くん。

それはそうと、上の写真の「段『さ』有り」と、下の写真の「段『差』有り」とを見比べてほしい。
上の看板の方が横広で寸詰まりでしょ。
だから、縦方向に詰まりがちな「差」の文字が敬遠されたんじゃないかな。
ではどうして「あり」ではなく「有り」なのかというと、やはり「なんとなく、漢字ひらがな漢字ひらがな、がいいと思ったのかもしれない」ね。